Investigadores del Laboratorio Cold Spring Harbor (CSHL) han desarrollado la primera aplicación de analizador de secuencias del genoma móvil del mundo para teléfonos inteligentes.
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El laboratorio móvil, que los fanáticos de la ciencia ficción podrían argumentar suena sospechosamente como el dispositivo «tricorder» de Star Trek, funciona en conjunto con secuenciadores como Illumina, Ion Torrent, PacBio u Oxford Nanopore para tomar muestras de ADN que luego se analiza en la aplicación para iPhone llamada iGenomics .
Los investigadores afirman que el sistema evita la necesidad de equipos de laboratorio voluminosos pero sensibles, liberando a todos desde especialistas en pandemias y riesgos biológicos y socorristas hasta ecólogos que trabajan en el campo, en algunas de las partes más remotas del planeta, así como al consumidor promedio.
El ingeniero de software Aspyn Palatnick programó iGenomics durante los últimos ocho años, comenzó a trabajar cuando tenía solo 14 años, trabajando como pasante en el laboratorio del profesor adjunto adjunto de CSHL Michael Schatz.
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Según el equipo de investigación, el sistema capitaliza los avances en la tecnología de secuenciadores, así como las impresionantes ganancias en la potencia de procesamiento de los teléfonos inteligentes, para hacer que los estudios del genoma sean más portátiles, accesibles y asequibles.
Los usuarios ahora pueden simplemente secuenciar los datos de AirDrop entre sí sin la necesidad de acceso a Internet a servidores de investigación alojados, lo que permite que se lleve a cabo un trabajo muy avanzado en las fronteras de la medicina, que pronto pueden incluir la órbita terrestre y más allá.
«Hay mucho interés en realizar la secuenciación de ADN en el espacio. Estoy tratando de ver si hay alguna manera de que iGenomics llegue allí», dice Schatz.
“Es un verdadero testimonio de cómo sería imposible hacer, ya sabes, cualquier tipo de análisis en computadoras normales. Es simplemente imposible traerlos contigo «.
Según se informa, el algoritmo iGenomics puede mapear secuencias de ADN de patógenos virales, desde cepas de gripe aviar hasta el virus Zika, al tiempo que identifica mutaciones que podrían ahorrar un tiempo crucial tanto en el diagnóstico como en el tratamiento de la enfermedad.
El equipo de desarrollo de iGenomics también compartió un tutorial en línea que detalla cómo analizar los genomas del SARS-CoV-2.
«Hoy en día, todos llevamos cámaras profesionales en nuestros bolsillos, por lo que no es tan difícil imaginar que en los próximos años todos llevemos nuestros propios secuenciadores de ADN en nuestros teléfonos inteligentes», escriben los investigadores, y agregan que la gente pronto podría ser capaces de escanearse a sí mismos en busca de patógenos usando solo sus teléfonos inteligentes, lo que puede resultar crucial en una era posterior a Covid-19.
